Microbioom: Bacteriën helpen bedreigde diersoorten te beschermen

bacteriën om diersoorten te redden

Biologen zijn nog bezig met het inventariseren van de micro-organismen die erop leven en de meeste bedreigde soorten, zegt zeebioloog Elisabeth Dinsdale van de Flinders University. Ze duikt met haaien om hun huidmicrobioom te testen. Ongeveer 90 procent van alle organismen die ze daar aantreft, zijn nieuwe soorten en haar team heeft verschillende groepen walvishaaien geïdentificeerd op basis van hun typische huidmicrobioom.

De volgende grote vraag is wat al deze micro-organismen precies doen voor hun gastheer. Sequencing van het hele genoom kan aanwijzingen geven omdat het genen identificeert die taken uitvoeren zoals het verteren van plantenvezels, het verdragen van hoge zoutgehaltes of het onschadelijk maken van zware metalen. Het kweken van culturen in het laboratorium om de rol van micro-organismen te bepalen, is echter nog steeds tijdrovend, duur en zeer uitdagend voor veel micro-organismen. Geautomatiseerde procedures beloven echter het proces te versnellen. Op deze manier kunnen experts samen met anderen het gedrag van microben in de gemeenschap observeren.

Sommige onderzoekers experimenteren al met ‘microbiome engineering’, waarbij ze specifiek de samenstelling van microben veranderen. Bacteriële gemeenschappen in koraalslijm zijn bijvoorbeeld gevoelig voor temperatuur en verontreinigende stoffen – extreem hete zeeën kunnen koralen ertoe aanzetten symbiotische microalgen te verdrijven, ook wel koraalverbleking genoemd.

Australië test of koraalriffen het klimaat kunnen verharden door ze te behandelen met “een soort microbieel elixer” dat zich beter aanpast aan wisselende temperaturen, zegt Elizabeth Dinsdale. Andere ecologen in Australië hebben aangetoond dat het mogelijk is het microbioom van de koala te veranderen door het darmmicrobioom te verplaatsen, zodat de buideldieren andere soorten eucalyptus kunnen verteren.