Elke stad heeft zijn eigen kiemhandtekening

Stedelijke microben verschijnen in verschillende steden over de hele wereld met niet alleen een gemeenschappelijke basisset van bacteriesoorten, maar ook individuele verschillen

New York (VS) –

Iedereen heeft een heel individueel microbioom van zowel darm- als huidmicroben. Het is duidelijk dat elke stad ook een bijzonder ecosysteem is waarin zich een uniek spectrum van bacteriën, virussen en andere microben ontwikkelt, blijkt uit een rapport van een internationaal onderzoeksteam in het tijdschrift Cell. Dit stedelijke microbioom bestaat enerzijds uit een aandeel van enkele soorten bacteriën die in alle steden die over de hele wereld zijn onderzocht veel voorkomen, maar anderzijds wordt het aangevuld met extra soorten microben die van stad tot stad verschillen. . Volgens de auteurs zou de huidige informatie over hoe de populatie van microbiële soorten in een stad in de loop van de tijd is veranderd, vroege informatie kunnen opleveren over de risico’s van infectie en dreigende epidemieën.

“Met behulp van je schoenen kan ik je ongeveer 90 procent zekerheid vertellen uit welke stad je komt”, zegt Christopher Mason van het Weill Cornell Medical College in New York, hoofd van het onderzoeksproject. “Elke stad heeft zijn eigen” moleculaire resonantie “van typische microben. Daarom kan monitoring van stedelijke microben niet alleen van medisch en epidemiologisch belang zijn, maar ook forensisch onderzoek dienen.

Voor hun studie selecteerden de onderzoekers 60 grote steden in Europa, Noord- en Zuid-Amerika, Oost-Azië, Afrika, Australië en Oceanië. Deze omvatten New York, Brisbane, Hong Kong, Tokio, Kuala Lumpur, Hanoi, Wenen en Oslo, en als enige Duitse stad Berlijn. Op drie verschillende tijdstippen tussen 2015 en 2017 werden in totaal 4.728 monsters van wattenstaafjes verzameld van bussen en treinen, van stoelen, banken, leuningen, tourniquets en kaartverkooppunten. Met behulp van DNA-analyses hebben wetenschappers 4.246 bekende soorten microben geïdentificeerd, naast 748 voorheen onbekende soorten bacteriën en enkele duizenden soorten onbekende virussen.

READ  COVID-19-test op vakantie - Wetenschap en technologie

Een groep van 31 soorten bacteriën, waaronder stafylokokken, pseudomonas en micro-organismen, werd gedetecteerd in 97 procent van de monsters uit alle steden. De lijst van deze bacteriën verschilde van de spectrums van de soort die kenmerkend is voor bodembacteriën en menselijke lichaamsbacteriën. De meest voorkomende bacterie die in alle steden werd aangetroffen, was Cutibacterium acnes (voormalige naam: Propionibacterium acnes), een normale huidbacterie die ook betrokken is bij het ontstaan ​​van acne. Stedelijke microben omvatten ook Streptococcus, Klebsiella, Enterobacter en andere verwante medicinale agentia als mogelijke infectieuze agentia.

De onderzoekers onderzochten ook bacterieel DNA op genen die de microben resistent maken tegen antibiotica. De snelheid waarmee resistentiegenen werden ontdekt, varieerde sterk tussen steden. De factoren die verantwoordelijk zijn voor deze verschillen en het spectrum van verschillende microben in steden moeten nog worden onderzocht. Het stadsmicrobioom, dat regelmatig wordt geïdentificeerd, kan helpen bij het opsporen van infectie-uitbraken, het vroegtijdig verspreiden van resistente ziekteverwekkers en het snel nemen van preventieve maatregelen.

Geef een reactie

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd. Vereiste velden zijn gemarkeerd met *