De ontdekking van een nieuw type virus in Zuid-Afrika

C.1.2 bevat opvallend veel mutaties, maar is tot nu toe slechts verantwoordelijk voor een klein deel van de infectie

En opnieuw verscheen er een nieuw type Sars-CoV-2: in Zuid-Afrika ontdekte een onderzoeksteam van het National Institute of Infectious Diseases en verschillende Zuid-Afrikaanse universiteiten een stam genaamd “C.1.2” die een bijzonder groot aantal mutaties draagt. Sommige zijn al bekend van andere varianten zoals delta. De wetenschappers schreven dat de C.1.2-variant in alle provincies van het land is gedetecteerd, maar tot nu toe slechts een klein deel van het besmettingspercentage uitmaakt – zij het met een stijgende trend.

Over deze variant is nog veel onbekend. Het is nog niet mogelijk om te zeggen of C.1.2 besmettelijker is en bij besmetting een ernstigere ziekte veroorzaakt – en of het in staat is om de deltavariant die ook in Zuid-Afrika voorkomt, te verdrijven. De studie, “The Continuing Evolution of Sars-CoV-2 in South Africa: A New Strain with Rapid Accumulation of Mutations of Concern and Global Discovery”, werd gepubliceerd op Medrxiv en is nog niet onafhankelijk geëvalueerd.

C.1.2 zou verantwoordelijk zijn voor 0,2 procent van de virusgenomen die in mei 2021 in het laboratorium in Zuid-Afrika zijn gedetecteerd en gesequenced. De waarde zou in juni zijn gestegen tot 1,6 procent en in juli tot twee procent. Dit lijkt erg onbeduidend, maar de deltavariabele die momenteel in veel landen voorkomt, begon met zulke lage waarden. Er wordt gezegd dat de variant al is verschenen in andere landen van Afrika, in Europa – inclusief Zwitserland en Groot-Brittannië, maar niet in Duitsland – in China en Nieuw-Zeeland. De Wereldgezondheidsorganisatie (WHO) heeft C.1.2 nog niet geclassificeerd als een “zorgwekkende variabele” (bijv. alfa, bèta, gamma en delta) of een “variabele onder observatie”.

Het Zuid-Afrikaanse onderzoeksteam identificeerde gemiddeld 41,8 mutaties per jaar voor C.1.2, terwijl de andere varianten gemiddeld ‘slechts’ 25 genetische veranderingen per jaar laten zien. Dit betekent dat de mutatiesnelheid in C.1.2 ongeveer 1,7 keer zal zijn. Sommige van de mutaties die het spike-eiwit C.1.2 beïnvloeden, zouden eerder zijn opgetreden in andere varianten, waaronder bèta, gamma en alfa. Sommige van deze veranderingen zouden het vermogen van het virus om zich aan menselijke cellen te binden kunnen verbeteren. Ook met de delta-variant zijn er mutaties.

Een punt van zorg is dat sommige van de aanvullende genetische veranderingen die in C.1.2 zijn gedetecteerd, de bescherming die wordt geboden door vaccinatie of eerdere infectie verder kunnen aantasten dan de delta-variant. “Het kan zijn dat deze mutaties eigenschappen aantasten die het virus in staat stellen een immuunrespons te ontwijken of besmettelijker te maken”, zegt viroloog Megan Stein van Central Sydney Medical School in een artikel in The Guardian. Om Delta echter uit de weg te ruimen, moet de variator “zeer goed, zeer fit en zeer snel converteerbaar zijn”, geeft de wetenschapper toe. Hierdoor mislukte de bèta in Zuid-Afrika en werd deze teruggebracht door Delta. Dus de C.1.2-variant zal waarschijnlijk weer uitsterven, zegt Megan Stein.

De auteurs van het onderzoek uit Zuid-Afrika benadrukken dat verder onderzoek nodig is om de specifieke effecten van de in c. geïdentificeerde mutaties te begrijpen. Het kan daardoor worden verwijderd.